MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp26

Total Repeats: 666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017401	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827985
2	NC_017401	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827985
3	NC_017401	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827985
4	NC_017401	A	6	6	147	152	100 %	0 %	0 %	0 %	387827985
5	NC_017401	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	387827985
6	NC_017401	A	6	6	208	213	100 %	0 %	0 %	0 %	387827985
7	NC_017401	ATT	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827985
8	NC_017401	A	6	6	263	268	100 %	0 %	0 %	0 %	387827985
9	NC_017401	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827985
10	NC_017401	ACCTTA	2	12	348	359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827986
11	NC_017401	T	6	6	360	365	0 %	100 %	0 %	0 %	387827986
12	NC_017401	TGT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827986
13	NC_017401	AC	3	6	409	414	50 %	0 %	0 %	50 %	387827986
14	NC_017401	A	7	7	422	428	100 %	0 %	0 %	0 %	387827986
15	NC_017401	A	6	6	475	480	100 %	0 %	0 %	0 %	387827986
16	NC_017401	A	6	6	537	542	100 %	0 %	0 %	0 %	387827986
17	NC_017401	T	6	6	596	601	0 %	100 %	0 %	0 %	387827986
18	NC_017401	AAAT	2	8	621	628	75 %	25 %	0 %	0 %	387827986
19	NC_017401	CTG	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827986
20	NC_017401	T	7	7	718	724	0 %	100 %	0 %	0 %	387827986
21	NC_017401	A	7	7	725	731	100 %	0 %	0 %	0 %	387827986
22	NC_017401	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
23	NC_017401	TA	3	6	882	887	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
24	NC_017401	ATC	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827987
25	NC_017401	AT	3	6	1028	1033	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
26	NC_017401	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827987
27	NC_017401	TAT	2	6	1139	1144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
28	NC_017401	GTT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827987
29	NC_017401	AAT	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827987
30	NC_017401	AGAC	2	8	1310	1317	50 %	0 %	25 %	25 %	387827987
31	NC_017401	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
32	NC_017401	TAT	2	6	1361	1366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
33	NC_017401	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827987
34	NC_017401	AATT	2	8	1445	1452	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
35	NC_017401	AAC	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827987
36	NC_017401	ATT	2	6	1500	1505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
37	NC_017401	T	6	6	1513	1518	0 %	100 %	0 %	0 %	387827987
38	NC_017401	GAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827987
39	NC_017401	ATT	2	6	1663	1668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
40	NC_017401	AATT	2	8	1685	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
41	NC_017401	T	6	6	1727	1732	0 %	100 %	0 %	0 %	387827987
42	NC_017401	ACAA	2	8	1777	1784	75 %	0 %	0 %	25 %	387827987
43	NC_017401	TCA	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827987
44	NC_017401	ATTTG	2	10	1822	1831	20 %	60 %	20 %	0 %	387827987
45	NC_017401	T	8	8	1850	1857	0 %	100 %	0 %	0 %	387827987
46	NC_017401	T	6	6	1876	1881	0 %	100 %	0 %	0 %	387827987
47	NC_017401	TTC	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827987
48	NC_017401	A	7	7	1907	1913	100 %	0 %	0 %	0 %	387827987
49	NC_017401	A	6	6	1915	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	387827987
50	NC_017401	TAT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
51	NC_017401	AT	3	6	1960	1965	50 %	50 %	0 %	0 %	387827987
52	NC_017401	ATT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
53	NC_017401	ATT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827987
54	NC_017401	TTTC	2	8	2075	2082	0 %	75 %	0 %	25 %	387827987
55	NC_017401	T	6	6	2115	2120	0 %	100 %	0 %	0 %	387827987
56	NC_017401	T	6	6	2161	2166	0 %	100 %	0 %	0 %	387827987
57	NC_017401	TAA	2	6	2515	2520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
58	NC_017401	AAT	3	9	2550	2558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
59	NC_017401	A	8	8	2596	2603	100 %	0 %	0 %	0 %	387827988
60	NC_017401	AAT	2	6	2654	2659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
61	NC_017401	A	6	6	2712	2717	100 %	0 %	0 %	0 %	387827988
62	NC_017401	ATA	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
63	NC_017401	CCTA	2	8	2804	2811	25 %	25 %	0 %	50 %	387827988
64	NC_017401	CAT	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827988
65	NC_017401	CAC	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827988
66	NC_017401	AAG	2	6	2990	2995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827988
67	NC_017401	AAT	2	6	2999	3004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
68	NC_017401	ATA	2	6	3034	3039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
69	NC_017401	ATT	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827988
70	NC_017401	CAA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827988
71	NC_017401	CAG	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827988
72	NC_017401	T	7	7	3264	3270	0 %	100 %	0 %	0 %	387827988
73	NC_017401	A	6	6	3298	3303	100 %	0 %	0 %	0 %	387827988
74	NC_017401	AGC	2	6	3305	3310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827988
75	NC_017401	AAT	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
76	NC_017401	AGC	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827988
77	NC_017401	TCC	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827988
78	NC_017401	ACA	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827988
79	NC_017401	ATA	2	6	3540	3545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827988
80	NC_017401	TAAAA	2	10	3662	3671	80 %	20 %	0 %	0 %	387827988
81	NC_017401	AGT	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827988
82	NC_017401	A	7	7	4088	4094	100 %	0 %	0 %	0 %	387827989
83	NC_017401	TA	3	6	4095	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	387827989
84	NC_017401	AGA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827989
85	NC_017401	TGT	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827989
86	NC_017401	A	6	6	4238	4243	100 %	0 %	0 %	0 %	387827989
87	NC_017401	CA	3	6	4266	4271	50 %	0 %	0 %	50 %	387827989
88	NC_017401	ATA	2	6	4277	4282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827989
89	NC_017401	ATCA	2	8	4284	4291	50 %	25 %	0 %	25 %	387827989
90	NC_017401	TTTTA	2	10	4321	4330	20 %	80 %	0 %	0 %	387827989
91	NC_017401	GAA	2	6	4382	4387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827989
92	NC_017401	ATA	2	6	4406	4411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827989
93	NC_017401	A	7	7	4420	4426	100 %	0 %	0 %	0 %	387827989
94	NC_017401	A	6	6	4515	4520	100 %	0 %	0 %	0 %	387827990
95	NC_017401	CAA	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827990
96	NC_017401	GTT	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827990
97	NC_017401	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827990
98	NC_017401	CAC	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827990
99	NC_017401	TAA	2	6	4614	4619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827990
100	NC_017401	A	7	7	4618	4624	100 %	0 %	0 %	0 %	387827990
101	NC_017401	GAA	2	6	4630	4635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827990
102	NC_017401	AAT	2	6	4665	4670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827990
103	NC_017401	AATG	2	8	4692	4699	50 %	25 %	25 %	0 %	387827990
104	NC_017401	CAAT	2	8	4721	4728	50 %	25 %	0 %	25 %	387827990
105	NC_017401	AAGG	2	8	4754	4761	50 %	0 %	50 %	0 %	387827990
106	NC_017401	GAAA	2	8	4769	4776	75 %	0 %	25 %	0 %	387827991
107	NC_017401	ATT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
108	NC_017401	TAT	2	6	4952	4957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
109	NC_017401	ATT	2	6	5029	5034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
110	NC_017401	ATTAG	2	10	5058	5067	40 %	40 %	20 %	0 %	387827991
111	NC_017401	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
112	NC_017401	ATAA	2	8	5148	5155	75 %	25 %	0 %	0 %	387827991
113	NC_017401	AAT	2	6	5168	5173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
114	NC_017401	A	6	6	5192	5197	100 %	0 %	0 %	0 %	387827991
115	NC_017401	ACA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827991
116	NC_017401	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
117	NC_017401	TTA	2	6	5308	5313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827991
118	NC_017401	TAA	2	6	5318	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
119	NC_017401	AGA	2	6	5327	5332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
120	NC_017401	GAAA	2	8	5345	5352	75 %	0 %	25 %	0 %	387827991
121	NC_017401	AAG	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
122	NC_017401	AAG	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827991
123	NC_017401	A	7	7	5477	5483	100 %	0 %	0 %	0 %	387827991
124	NC_017401	AAT	2	6	5558	5563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
125	NC_017401	TAC	2	6	5634	5639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827991
126	NC_017401	AAT	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
127	NC_017401	A	6	6	5646	5651	100 %	0 %	0 %	0 %	387827991
128	NC_017401	A	6	6	5679	5684	100 %	0 %	0 %	0 %	387827991
129	NC_017401	TTC	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827991
130	NC_017401	AAT	2	6	5760	5765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
131	NC_017401	ATG	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827991
132	NC_017401	AT	3	6	5805	5810	50 %	50 %	0 %	0 %	387827991
133	NC_017401	A	6	6	5818	5823	100 %	0 %	0 %	0 %	387827991
134	NC_017401	ATA	2	6	5847	5852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827991
135	NC_017401	ATAA	2	8	5857	5864	75 %	25 %	0 %	0 %	387827991
136	NC_017401	ATA	3	9	5919	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827992
137	NC_017401	CT	3	6	5943	5948	0 %	50 %	0 %	50 %	387827992
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